Ο αρχιμανδρίτης Πρόδρομος Ξενάκης θεωρείται ως ένας εκ των στενότερων συνεργατών του Σεβασμιότατου Αρχιεπισκόπου Κρήτης κ. Ειρηναίου.
Άνθρωπος βαθύτατα καλλιεργημένος, δραστήριος, με ευρύτητα πνεύματος και άριστη γνώση των εκκλησιαστικών θεμάτων, η ανέλιξη του στα εκκλησιαστικά αξιώματα της Κρήτης ήταν παραπάνω από βέβαιη.
Το 2016 η Ιερά Επαρχιακή Σύνοδος της Εκκλησίας της Κρήτης τον εξέλεξε ομόφωνα στη θέση του αρχιγραμματέα (μετά την πανηγυρική εκλογή του Κύριλλου Διαμαντάκη ως Μητροπολίτη Ιεραπύτνης και Σητείας).
Ο ίδιος ο Αρχιεπίσκοπος είχε αναφερθεί τότε με ιδιαιτέρως επαινετικά λόγια και είχε ήδη καταστεί σαφές στους εκκλησιαστικούς κύκλους ότι το πρόσωπο αυτό θα διαδραματίσει σημαντικό ρόλο στα εκκλησιαστικά πράγματα του νησιού.
Η εκλογή του ως βοηθού επισκόπου (Επίσκοπος Κνωσσού), δεν αποτέλεσε έκπληξη για κανένα. Μία σημαντική θέση που παρέμενε κενή από το 2010 οπότε και ο τότε Επίσκοπος Κνωσού, κ. Ευγένιος, εξελέγη παμψηφεί Μητροπολίτης Ρεθύμνης και Αυλοποτάμου.
Στα χρόνια που μεσολάβησαν πληροφορίες ανέφεραν ότι ο Αρχιεπίσκοπος Κρήτης, κ. Ειρηναίος, είχε αποπειραθεί να δρομολογήσει τις διαδικασίες για την εκλογή-το θέμα αυτό αποτελεί καταστατικό δικαίωμα του Αρχιεπισκόπου- όμως λόγω εσωτερικών διαφωνιών και αντιδράσεων, το «πάγωσε», προκρίνοντας την ενότητα της Συνόδου.
Το 2016 το θέμα της εκλογής Βοηθού Επισκόπου ανακινήθηκε εκ νέου με την ευκαιρία της εκλογής του Μητροπολίτη Ιεραπύτνης και Σητείας, τελικά και πάλι παρέμεινε εκκρεμές για λόγους που συνυπολόγισε και συνεκτίμησε ο ίδιος ο Αρχιεπίσκοπος. Αυτή τη φορά ωστόσο φαίνεται ότι είχε φθάσει το πλήρωμα του χρόνου ώστε να προχωρήσει το θέμα.
Πληροφορίες αναφέρουν ότι από πλευράς Συνόδου υπήρξε ομόφωνη εισήγηση προς τον Αρχιεπίσκοπο να δρομολογήσει την διαδικασία της εκλογής. Μία εισήγηση που είχε περισσότερο τον χαρακτήρα της παράκλησης για να κλείσει επιτέλους αυτό το θέμα.
Ο Σεβασμιότατος Αρχιεπίσκοπος Κρήτης συμφώνησε και κατάρτισε το τριπρόσωπο, το οποίο αποτέλεσαν ο αρχιμανδρίτης Πρόδρομος Ξενάκης, ο πρωτοσύγκελος της Αρχιεπισκοπής Κρήτης Μεθόδιος Βερνιδάκης και ο Ηγούμενος της Μονής Γουβερνέτου, Ειρηναίος Βερυκάκης.
Ο Πρόδρομος Ξενάκης έλαβε επτά ψήφους και από μία ψήφο έλαβαν οι ανθυποψήφιοι του. Απογευματινές ώρες χθες οι κλειδωμένες πόρτες άνοιξαν διάπλατα και οι καμπάνες του Μητροπολιτικού Ναού του Αγίου Μηνά άρχισαν να ηχούν χαρμόσυνα.
Η χειροτονία του νέου Βοηθού Επισκόπου θα τελεστεί στις 26 Οκτωβρίου στον Ιερό Μητροπολιτικό Ναό του Αγίου Μηνά. Ο Πρόδρομος Ξενάκης χειροτονήθηκε διάκονος από τον τότε Επίσκοπο Κνωσσού Ευγένιο (Μητροπολίτη Ρεθύμνης και Αυλοποτάμου).
Νέος αρχιγραμματέας της Ιεράς Συνόδου εξελέγη ο αρχιμανδρίτης Νήφων Βασιλάκης.
Το βιογραφικό του Επισκόπου Κνωσού
Ὁ Θεοφιλ. Ἐψηφισμένος Ἐπίσκοπος Κνωσοῦ κ. Πρόδρομος (κατά κόσμον Ζαχαρίας Ξενάκης) γεννήθηκε στά Σταυράκια Ἡρακλείου, τήν 3η Νοεμβρίου 1979. Μετά τίς ἐγκύκλιες σπουδές, φοίτησε στή Θεολογική Σχολή τοῦ Πανεπιστημίου Ἀθηνῶν, ἀπ᾽ ὅπου ἔλαβε τό πτυχίο του τόν Σεπτέμβριο τοῦ 2001.
Κατόπιν Σεπτῆς Ἐντολῆς τῆς Α.Θ.Π. τοῦ Οἰκουμενικοῦ Πατριάρχου κ.κ. Βαρθολομαίου, μετέβη, κατά τή διετία 2010 – 2012, στό Κολλέγιο τοῦ Ἁγίου Πατρικίου στό Maynooth Ἰρλανδίας, ὅπου παρακολούθησε καί περάτωσε ἐπιτυχῶς Πρόγραμμα Μεταπτυχιακῶν Σπουδῶν στή Βιβλική Θεολογία, μέ ὑποτροφία τῆς Ρωμαιοκαθολικῆς Ἐκκλησίας.
Ἐκάρη μοναχός στήν Ἱερά Μονή Ὁσίας Εἰρήνης Χρυσοβαλάντου Ἡρακλείου, τόν Ἰανουάριο τοῦ ἔτους 2005 ἀπό τόν Θεοφ. Ἐπίσκοπο Κνωσοῦ (νῦν Σεβ. Μητροπολίτη Γορτύνης καί Ἀρκαδίας) κ. Μακάριο καί χειροτονήθηκε διάκονος τόν Ἰούνιο τοῦ ἔτους 2005 ἀπό τόν Θεοφ.
Ἐπίσκοπο Κνωσοῦ (νῦν Σεβ. Μητροπολίτη Ρεθύμνης καί Αὐλοποτάμου) κ. Εὐγένιο. Πρεσβύτερος χειροτονήθηκε ἀπό τόν Σεβ. Ἀρχιεπίσκοπο Κρήτης κ. Εἰρηναῖο, τόν Ἰανουάριο τοῦ ἔτους 2013, προχειρισθείς τήν ἴδια ἡμέρα σέ Ἀρχιμανδρίτη.
Ὑπηρέτησε στήν Ἱερά Ἀρχιεπισκοπή Κρήτης ὡς διάκονος τοῦ Σεβ. Ἀρχιεπισκόπου, Γενικός Ἀρχιερατικός Ἐπίτροπος, Ἀρχιερατικός Ἐπίτροπος τῆς Α’ Ἀρχ. Περιφερείας, Γραμματέας τοῦ Μητροπολιτικοῦ Συμβουλίου τῆς Ἱερᾶς Ἀρχιεπισκοπῆς, Μέλος τοῦ Διοικητικοῦ Συμβουλίου τοῦ Ἐπικοινωνιακοῦ καί Μορφωτικοῦ Ἱδρύματος αὐτῆς καί Μέλος τοῦ Διοικητικοῦ Συμβουλίου τοῦ Γενικοῦ Φιλοπτώχου Ταμείου τῆς Ἱερᾶς Ἀρχιεπισκοπῆς Κρήτης, Ὑπεύθυνος Νεότητος καί παραγωγός Ραδιοφωνικῶν Ἐκπομπῶν στό Ραδιοφωνικό Σταθμό «ΤΟ ΦΩΣ» τῆς Ἱερᾶς Ἀρχιεπισκοπῆς Κρήτης.
Ὑπηρέτησε τήν Ἱερά Σύνοδο ἀπό τίς θέσεις τοῦ Κωδικογράφου (Ἰανουάριος 2008 – Σεπτέμβριος 2010), τοῦ Ὑπογραμματέως (Σεπτέμβριος 2010 – Ὀκτώβριος 2016) καί τοῦ Ἀρχιγραμματέως (ἀπό Ὀκτώβριο 2016). Διετέλεσε Διευθυντής Συντάξεως τοῦ Ἐπισήμου Δελτίου τῆς Ἐκκλησίας Κρήτης, μέλος καί γραμματεύς διαφόρων Συνοδικῶν Ἐπιτροπῶν τῆς Ἱερᾶς Συνόδου.
Μετεῖχε σέ Ἀντιπροσωπείες τῆς Ἐκκλησίας Κρήτης στό Οἰκουμενικό Πατριαρχεῖο καί στήν Ἑλληνική Κυβέρνηση καί εἶναι ὑπεύθυνος τοῦ Γραφείου Τύπου τῆς Ἱερᾶς Συνόδου.
Ὁ Θεοφιλ. Ἐψηφισμένος Ἐπίσκοπος Κνωσοῦ κ. Πρόδρομος θά διατηρήσει τή θέση τοῦ Ἀρχιγραμματέως τῆς Ἱερᾶς Ἐπαρχιακῆς Συνόδου τῆς Ἐκκλησίας Κρήτης.