Μετά την υποβολή 19 συμμετοχών στη Β’ Κατηγορία ΕΠΣΗ, η Επιτροπή Πρωταθλήματος της Ένωσης συνεδρίασε σχετικά με τη διεξαγωγή του πρωταθλήματος, προκειμένου να πραγματοποιηθεί ομαλά και να δώσουν όλες οι ομάδες περίπου τον ίδιο αριθμό αγώνων. Οι αποφάσεις που πάρθηκαν είναι οι κάτωθι:
Ο 1ος όμιλος συγκροτείται από 11 ομάδες και ο 2ος όμιλος από 8 ομάδες.
Στον 1ο όμιλο των 11 ομάδων θα διεξαχθεί πρωτάθλημα διάρκειας δύο γύρων με 22 αγωνιστικές και κάθε ομάδα θα δώσει 20 παιχνίδια (με ένα ρεπό σε κάθε γύρο)
Στον 2ο όμιλο των 8 ομάδων θα γίνει πρωτάθλημα διάρκειας τριών γύρων με 21 αγωνιστικές και κάθε ομάδα θα δώσει συνολικά 21 παιχνίδια (χωρίς ρεπό).
Για τον 2ο όμιλο μετά το τέλος του 2ου γύρου θα γίνει νέα κλήρωση για τον 3ο γύρο. Θα προβλέπεται ότι οι ομάδες από την 1η έως 4η θέση της βαθμολογίας θα παίξουν 4 ματς εντός και 3 εκτός έδρας και οι ομάδες από την 5η έως 8η θέση θα παίξουν 3 ματς εντός και 4 εκτός έδρας.
Για τον καλύτερο προγραμματισμό γηπέδων, ημέρας διεξαγωγής αγώνων, αποστάσεων κ.λπ. και την ομαλή διεξαγωγή της Β’ Κατηγορίας ΕΠΣΗ, η Επιτροπή Πρωταθλήματος προχώρησε στη συγκρότηση των ομίλων, εκτιμώντας και γεωγραφικά κριτήρια.
1ος όμιλος (11 ομάδες)
Αλμυρός Β
Ασήμι
Ατρόμητος
Δειλινά
Δόξα Γαλιάς
Εργοτέλης Β
Θέρισσος
Μινωική Β
ΑΕ Πενταχωρίου
Τηγανίτης
Snakes FC
2ος όμιλος (8 ομάδες)
Άγιος Ιωάννης
Δόξα Ηρακλείου
Ελπίδες Καρτερού
Ερμής Ατσαλένιου
Ηρακλής Νιπιδιτού
Κουνάβοι
Παίδες Ηροδότου
Π.Ο.Η.
Τη Δευτέρα στις 7,30μ.μ. στη Γέργερη («λίμνη του Διγενή») θα πραγματοποιηθούν οι κληρώσεις των τοπικών πρωταθλημάτων της ΕΠΣΗ.